Le virus de la grippe aviaire est très sensible à la chaleur. Chauffé à 56°C pendant 30 minutes, ou à 60°C pendant 10 minutes, ou à 65-70°C pendant quelques minutes, il devient inactif. Mais il résiste au froid, restant actif pendant plus d'une année sous une protection de glycérine.

Les rayons ultraviolets peuvent aussi tuer le virus. Exposé au soleil, le virus devient inactif après 40 à 48 heures.

De plus, le virus est aussi sensible à l'éther sulfurique, au chloroforme, et à l'acétone. Les désinfectants comme la formaline et les oxydants peuvent détruire sa virulence.